同房后两侧输卵管隐隐作痛考虑是输卵管炎、子宫内膜炎、宫颈炎、子宫内膜异位症、卵巢囊肿等原因，需要通过药物以及手术治疗，必要时需要就医。

1、输卵管炎：

如果同房后没有做好局部清洁卫生，导致炎症刺激输卵管部位，诱发炎症反应，引起输卵管隐痛、白带增多等症状。可以在医生的指导下服用阿莫西林胶囊、头孢呋辛酯片、头孢克肟胶囊等药物治疗，服用药物时需要使用温水送服，以免破坏药物成分。

2、子宫内膜炎：

如果性生活不洁，容易损伤子宫内膜部位，造成局部发炎，引起阴道分泌物增多、腹部隐痛等症状。需要遵医嘱服用盐酸左氧氟沙星片、盐酸莫西沙星片、诺氟沙星胶囊等药物治疗，能够起到消炎抗菌的效果。

3、宫颈炎：

若同房后没有及时清洁生殖器，会导致病原体侵袭宫颈部位，造成宫颈管黏膜损伤，出现腹部隐隐作痛、阴道异常出血等症状。可遵医嘱服用头孢克洛分散片、罗红霉素胶囊、阿奇霉素分散片等药物治疗，具有消炎的效果，控制病原体增多。

4、子宫内膜异位症：

如果患有本疾病，同房时会对子宫内膜以及输卵管造成损伤，当同房后会导致局部出现隐隐作痛的情况。需要在医生的操作下进行手术切除病灶治疗，能够减轻患病后引起的不适症状。

5、卵巢囊肿：

是生长在卵巢部位的囊肿，在同房时可能会刺激局部，输卵管部位损伤，引起疼痛，伴有阴道分泌物异常。可以在医生的操作下进行患侧卵巢切除术、卵巢囊肿剥除术治疗，术后应以半流质食物为主，不可以暴饮暴食。

治疗期间需要保证充足睡眠，不可以长时间熬夜，否则会影响体内激素分泌，导致疾病加重。